分署沿革
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- 民國50年
- 台灣省政府農林廳下成立山地農牧局，專責山坡地保育利用工作，於彰化縣員林鎮、南投縣集集鎮分別設立第一及第五工作處。
- 民國63年
- 調整員額將第一及第五工作處合併改制為第三工作處並設址於南投縣南投市。
- 民國78年
- 山地農牧局改制為水土保持局，以加強山坡地保育及管理工作，山地農牧局第三工作處亦隨之改制為水土保持局第三工程所。
- 民國88年
- 精省後改隸為行政院農業委員會水土保持局第三工程所。
- 民國97年
- 水土保持局第三工程所改制為水土保持局南投分局。
- 民國112年8月1日
- 行政院農業委員會升格農業部，水土保持局南投分局改制更名為農業部農村發展及水土保持署南投分署